Seit Anfang der 1990 hat das Familienstellen nach Hellinger einerseits sehr viele Menschen angezogen, andererseits zu heftigen Debatten unter den Psychotherapie-Schulen geführt.
Ein Teil der Kritik richtet sich gegen die Person Hellingers, ein Teil gegen die von ihm entwickelten Techniken. Die große Mehrheit der nach Virginia Satir arbeitenden Familientherapeuten und deren Vereinigung, die Deutsche Gesellschaft für Systemische Therapie und Familientherapie (DGSF), distanzierten sich mittlerweile von Bert Hellinger in einer gemeinsamen Erklärung und bezeichnen seine Methoden darin als "ethisch nicht vertretbar und gefährlich für die Betroffenen zu beurteilen".
Konkret wird Hellinger vorgeworfen, gegen einfachste Regeln der Psychotherapie zu verstoßen und im Anschluss an eine Sitzung seine Klienten allein zu lassen und ihnen nicht zu helfen, ihre Eindrücke und oft starke emotionale Anspannung zu verarbeiten.